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Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold
Jumper et al. · Nature 596, 583–589 (2021)
https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2

1. 研究问题
研究想回答什么？
如何从氨基酸序列预测蛋白质结构？先明确任务，再区分预测目标与验证依据。
原文位置：摘要 · Fig. 1

2. 证据关系
主张由什么支持？
论文通过 CASP14 及后续结构数据评估预测表现。pLDDT 用于估计局部预测可靠性。
原文位置：Fig. 1–2 · Results

3. 适用边界
哪些结论不能外推？
浅层多序列比对、对其他蛋白链接触的依赖会影响预测。结构预测表现不等于功能或药效已获验证。
原文位置：Fig. 5 · MSA depth and cross-chain contacts

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